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Métagénomique

Technologies omiques

Métagénomique

La métagénomique permet d’analyser de manière intégrale le microbiote dans les aliments, ingrédients, eaux, surfaces et matrices environnementales ou industrielles grâce au séquençage massif de l’ADN sans nécessité de culture. Cette technologie offre une résolution sans précédent de la diversité génétique microbienne, permettant de détecter même des organismes non cultivables et de comprendre comment les formulations, les procédés et les conditions environnementales influencent la qualité, la stabilité et la sécurité microbiologique.

Aplicaciones

Grâce à cette technologie, nous pouvons détecter, identifier et quantifier les micro-organismes et les fonctions microbiennes dans une large variété de matrices. En particulier :

Identification des bactéries, champignons et archées dans les aliments, ingrédients, eaux, surfaces et environnements environnementaux et industriels.

Identification des micro-organismes responsables de la détérioration, des déviations dans les procédés fermentaires ou de la contamination croisée.

Analyse des changements du microbiote après une nouvelle formulation, des traitements thermiques, des hautes pressions, des fermentations ou tout au long de la durée de vie du produit.

Détection de gènes associés à la résistance antimicrobienne (RAM), à la virulence et aux voies métaboliques permettant d’évaluer les capacités fonctionnelles du microbiote et leur influence sur la qualité et la stabilité du produit.

Suivi des cultures de démarrage (starter cultures) et de l’évolution du microbiote afin de garantir que la fermentation progresse correctement et maintient le profil sensoriel et la qualité attendue du produit.

Cartographie du microbiote dans les installations, usines, salles blanches, surfaces et équipements afin d’identifier les niches, biofilms et flore persistante dans les lignes de production.

Avantages concurrentiels d’AINIA

Large expérience de travail avec des aliments, ingrédients, eaux, surfaces et environnements industriels où les méthodes traditionnelles présentent des limitations.

Nous disposons d’une plateforme de séquençage massif à haut débit permettant des analyses métagénomiques avec une grande profondeur, une flexibilité de configuration et une haute qualité de données.

Nous disposons de serveurs d’analyse à haute performance et de pipelines validés pour la taxonomie, le résistome, la métagénomique fonctionnelle et les études comparatives entre lots, ainsi que la possibilité de développer des flux d’analyse personnalisés.

Adaptation rapide des protocoles pour de nouvelles formulations, produits innovants, incidents qualité ou besoins spécifiques en R&D et sécurité alimentaire.

Complémentarité avec la culture, qPCR, PCR digitale, v-PCR et analyses physicochimiques dans le cadre de plans analytiques coordonnés, offrant une vision globale de la qualité et de la sécurité du produit.

Support spécialisé tout au long du projet et accès en ligne aux résultats et à la traçabilité des échantillons via la plateforme MyLab.

Équipements clés

Plateforme de séquençage massif à haut débit

Avec haute résolution pour les profils volatils complexes et les études d’authenticité.

Laboratoire des omiques

Infrastructure avancée partagée avec des plateformes de protéomique et de métabolomique, adaptée aux projets intégrés et à la caractérisation moléculaire approfondie.

Serveurs d’analyse bioinformatique

Systèmes à haute performance avec grande capacité de stockage et pipelines validés pour l’analyse NGS, le résistome, la métagénomique fonctionnelle et la comparaison entre lots.

Cas remarquables

Contrôle de l’oxyde d’éthylène

Face au besoin urgent de disposer d’une méthode fiable pour le contrôle de l’oxyde d’éthylène ayant affecté de multiples secteurs, y compris le contrôle officiel, nos laboratoires ont été les premiers au niveau européen à disposer de l’analyse de cette substance dans un nombre important de matrices alimentaires, ce qui nous a également permis d’être les premiers désignés comme laboratoire pour le contrôle officiel par les autorités de notre pays. Tout cela a permis aux entreprises alimentaires de disposer de leurs propres contrôles sur des matières premières telles que les épices, fruits secs, graines et autres ingrédients concernés.

CEN / Norme EN-ISO 18465

AINIA fait partie du groupe de travail du Comité Européen de Normalisation CEN/TC275/WG6 “Microbiology of the food chain”, dans lequel il a participé à la validation européenne de la norme EN-ISO 18465 pour l’analyse de la toxine céréulide.

Secteurs d’application

Alimentaire

Chimique

Cosmétique

Environnement

Pharmaceutique

Agricole

Sanitaire

Industriel

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Elías Hurtado

Études omiques

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