- Laboratorio
Caracterización microbiológica mediante biología molecular
Las técnicas de biología molecular
Las técnicas de biología molecular permiten detectar, identificar, tipar y cuantificar microorganismos basándose en sus ácidos nucleicos (ADN o ARN), independientemente de su capacidad de crecer en cultivo. Esto es especialmente útil para microorganismos viables pero no cultivables, como norovirus y Candidatus Liberibacter sp., entre otros.; matrices inhibidoras o situaciones donde se busca alta sensibilidad, especificidad y rapidez.
AINIA dispone de experiencia para el desarrollo y puesta a punto de distintas técnicas de biología molecular para asegurar la calidad y seguridad de los productos e instalaciones, razón por la que incluye en su cartera de servicios multitud de técnicas de biología molecular para la detección rápida de patógenos.
Aplicaciones
Existen distintos tipos de técnicas de biología molecular mediante las que se puede detectar y cuantificar de forma específica genes y fragmentos de ADN y ARN de microorganismos de interés. Estos microorganismos pueden ser de interés por su capacidad patogénica, alterante o por sus beneficios para la salud, la alimentación humana y animal, la agricultura (biocontrol y biofertilizantes), el medioambiente (biorremediación), y para procesos industriales y biotecnológicos, siendo en estos casos clave la evaluación de su autenticidad y concentración. Como técnicas a aplicar disponemos:
- PCR convencional permite la detección cualitativa de un gen o fragmento específico de ADN, se aplica en confirmación de colonias, detección de genes de virulencia o resistencia, identificación básica.
- PCR a tiempo real se basa en la detección y cuantificación relativa de ADN (copia del gen objetivo), se aplica en el control microbiológico rápido de patógenos y alterantes en aguas, alimentos, fertilizantes, material vegetal, soportes para muestreo de superficies (hisopos, toallitas, etc.), cosméticos y Farma.
- RT-qPCR (Reverse Transcription PCR) permite la detección y cuantificación de ARN (viral, ribosomal o mensajero), se aplica en el control de Virus ARN (norovirus, Hepatitis A), estudios de expresión génica y viabilidad microbiana.
- PCR Multiplex se centra en la detección simultánea de varios genes o microorganismos en una sola reacción, se aplica en Paneles de patógenos, detección de serotipos, genes de resistencia o virulencia.
- PCR Digital (dPCR) determina la cuantificación absoluta de ADN sin necesidad de curva estándar, se aplica en la detección de patógenos en baja concentración, matrices complejas, y en el seguimiento y autenticidad de cepas de interés en distintos productos (formulaciones infantiles, probióticos, fertilizantes, complementos alimentarios, cultivos iniciadores, etc.), valorando su concentración en valor absoluto.
- PCR de Viables (vPCR — Viability PCR) permite distinguir microorganismos vivos de los muertos mediante PCR, utilizando para ello, agentes intercalantes del ADN, pudiendo detectar solo células sin cultivo, facilitando la validación de eficacia de desinfectantes, control rápido de viabilidad, análisis de VBNC (Viable But NonCulturable) en cosméticos, farma y alimentos.
- REP-PCR se basa en la amplificación de regiones entre secuencias repetitivas palindrómicas extragénicas (REP), generando patrones genéticos para diferenciar cepas, se aplica en tipificación y diferenciación de cepas bacterianas, estudios epidemiológicos, control de calidad y trazabilidad de cepas en microbiología alimentaria, ambiental o clínica, y comparación de diversidad genética dentro de una especie.
| Técnica | Principio | Objetivo | Ventajas | Aplicaciones en Microbiología |
|---|---|---|---|---|
| PCR Convencional | Amplificación de ADN mediante ciclos térmicos; detección final por electroforesis. | Detección cualitativa de genes específicos. | Simple, económica, muy específica. | Confirmación de colonias, detección de genes de virulencia o resistencia, identificación básica. |
| PCR en Tiempo Real (qPCR) | Amplificación y detección simultánea mediante fluorescencia (SYBR Green o sondas). | Detección y cuantificación de ADN. | Alta sensibilidad, rapidez, cuantificación absoluta/relativa. | Recuentos rápidos, control microbiológico en agua, alimentos, cosméticos y farma; P/A por Ct. |
| RT-PCR / RTqPCR | Conversión de ARN a ADNc (transcripción inversa) seguido de PCR o qPCR. | Detección o cuantificación de ARN. | Indica viabilidad/actividad metabólica; esencial para virus ARN. | Virus ARN (norovirus, SARS CoV-2), expresión génica, estudios de viabilidad. |
| PCR Multiplex | Amplificación simultánea de varios genes mediante múltiples cebadores. | Detectar varios microorganismos o genes a la vez. | Ahorro de tiempo y reactivos; análisis multigénico. | Paneles de patógenos, serotipado, genes de resistencia. |
| PCR Digital (dPCR) | Particionado de la muestra en miles de microreacciones y cuantificación absoluta. | Cuantificación absoluta sin curva estándar. | Extremada precisión; menos afectada por inhibidores; ideal para cargas bajas. | Matrices complejas, patógenos de baja concentración, estudios de mutaciones minoritarias. |
| PCR de Viables (vPCR) | Uso de colorantes intercalantes (PMA/EMA) que bloquean el ADN de células muertas. | Diferenciar viables vs. no viables. | Selectividad hacia células vivas sin cultivo; útil en matrices con conservantes. | Control rápido de viabilidad, validación de desinfectantes, estudio de células VBNC. |
| REP-PCR | Amplificación de regiones entre secuencias repetitivas palindrómicas extragénicas (REP). | Generar patrones genéticos (fingerprints) para diferenciar cepas. | Rápida, económica, buena resolución para estudios de diversidad y trazabilidad. | Tipificación y diferenciación bacteriana, estudios epidemiológicos, control de calidad y trazabilidad de cepas, comparación de diversidad genética dentro de una misma especie. |
Ventajas competitivas de AINIA
- Servicios integrales de ensayos microbiológicos con asesoramiento técnico para seleccionar metodología óptima por producto y finalidad (I+D, control de calidad, optimización de procesos).
- Disponibilidad de procedimientos de referencia, normas ISO, acreditados por ENAC y CRBG (Colección de recursos biológicos y genéticos), para desempeñar la validación y verificación de métodos alternativos basados en técnicas de biología molecular en alimentos, de acuerdo con la norma ISO 16140.
- Agilidad en el diseño y puesta a punto de métodos específicos basados en técnicas de biología molecular para la detección, cuantificación y tipificación concreta de microorganismos de interés por la empresa.
- Amplia cartera de servicios acreditados por ENAC para el análisis rápido de patógenos alimentarios (Salmonella spp., Listeria monocytogenes, E.coli productor de toxina shiga STEC, Yersinia enterocolítica patogénica, norovirus, Hepatitis A, etc.) y fitopatógenos (plagas prioritarias como Xylella fastidiosa, Candidatus Liberibacter sp., etc., de acuerdo con normas EPPO), entre otros.
- Integración en planes analíticos personalizados junto a otros servicios fisicoquímicos aportando soluciones flexibles y adaptadas a cada cliente.
- Acuerdos analíticos con liberación positiva y actividad en fin de semana.
- Designados como control oficial para ensayos basados en la aplicación de técnicas de biología molecular (qPCR, RT-PCR, etc.)
Plataforma MyLab
Consulta online de la trazabilidad de muestras, resultados en tiempo real, comparativas con especificaciones legales o de cliente, descarga de informes y del histórico en Excel.
Ir a MyLab
Solicitudes online
Solicitudes online ágiles y trazables mediante el módulo de alta de peticiones de MyLab.
Alertas automáticas
Alertas automáticas ante incumplimientos de límites legales o requisitos del cliente.
Servicio urgente
Servicio urgente con plazos de entrega de resultados especialmente reducidos.
Informes en inglés
Informes en inglés sin coste adicional, previa solicitud.
Equipo especializado para la toma y recogida de muestras
Equipo especializado para la toma y recogida de muestras (superficies, ambientes, establecimientos designados…).
Servicios alertas 24h
Servicios alertas 24h para cubrir emergencias en el ámbito de seguridad alimentaria.
Atención al cliente directa para cualquier consulta técnica o administrativa
(tel: 963 052 525 · mail: operaciones@ainia.es).
Equipamiento destacado
Sectores de aplicación
Alimentario
Químico
Cosmético
Medioambiente
Farmacéutico
Agrícola
Sanitario
¿Quieres saber más?
Déjanos tus datos y te contactaremos para resolver tus dudas o continuar la conversación.
Sonia Marco
Responsable Laboratorio Microbiología
